苏北行政公署于史公祠初建扬州“文物馆”；同年11月，筹建“苏北博物馆”，属苏北文教处；12月，改名为“苏北扬州博物馆”，属苏北文化局，下设文物、保管、大众科学部、秘书室4个部门。

     改名为“江苏扬州博物馆”，隶属江苏省文化局领导，由地方代管，在史公祠内与苏北文物保管委员会合署办公。

     5月，建立“扬州博物馆”，馆址设于史公祠，与扬州市文物管理委员会合署办公。

     扬州博物馆于个园办公（1964年撤出）。

     扬州博物馆被明确为科级单位。

     10月，扬州博物馆迁址天宁寺内，全馆人员编制增加到44人，馆长室下设办公室、保卫科、陈列部、保管部、考古部、技术部、群工部、研究室8个部门。

     扬州博物馆被命名为“省级爱国主义教育基地”。

     8月，扬州中国雕版印刷博物馆经国务院批准成立。

    10月，扬州博物馆新馆与扬州中国雕版印刷博物馆竣工，全面对外开放，馆内设有《广陵潮—扬州古代城市故事》《书画厅》《国宝厅》《古代艺术厅》《中国雕版印刷展厅》《扬州雕版印刷展厅》《特展厅》和《现代艺术馆》共8个展厅，并设有游客服务中心、商品服务部和文博体验中心；12月，扬州博物馆被批准为副处级单位。

    5月“扬州中国雕版印刷博物馆陈列”，荣获第七届全国十大陈列展览精品评选“最佳形式设计奖”；11月，被评为国家AAAA级旅游景区。

     2月，实行对外免费开放；5月，被国家文物局公布为首批国家一级博物馆；2008年4月-2021年4月，扬州博物馆增管扬州中国佛教文化博物馆。

     2月，经国家文物局批准，与荆州文保中心联合共建“出土木漆器保护国家文物局重点科研基地扬州工作站”。

     9月，扬州博物馆被中宣部命名为全国爱国主义教育示范基地。

     5月，经中共扬州市机构编制委员会办公室批准，馆长室下设10个部门，分别为办公室、宣传教育部（信息中心）、保卫部、后勤保障部、典藏部、展览部、文物保护研究中心、研究部（雕版印刷研究中心）、文化创意部、马可·波罗纪念馆管理办公室。